微濾機應放置于與待處理水面相平的位置，污水是自己流入微濾機的滾筒內部的。在排水水泵啟動后，滾筒外部的水位會下降，水將會 從滾筒內部向外部流動。水中的污物被不銹鋼篩網攔截。運行一段時間后，被不銹鋼篩網攔截到的污物越來越多，對水流的阻力越來越大，但排水流量卻因為水泵的穩定運行而未曾減少，于是滾筒外部的水位不斷下降。當水位下降到水位控制器所在的位置時，水位控制器會將電信號傳遞給控制中心，控制中心將啟動滾筒電機和加壓水泵。滾筒開始緩慢轉動，同時，高壓水泵將高壓水從噴嘴里泵出，高壓水將粘附在 篩網上的污物沖洗掉，污物被置于滾桶內部的集污槽所收集，然后從排污管排出。完成固液分離的過程。當滾桶內部的污物被沖洗，伴隨著滾桶的轉動，滾桶內外的水位又保持持平，微濾機又進入下一個循環。
微濾式固液分離機可以采用平衡飼料管理減少養分排泄磷；采用合理的清糞工藝和固液分離處理，以減少廢水磷排放，提高固體糞便磷收集率；采用堆肥處理減少糞肥體積，方便運輸減小區域磷載荷；沼氣處理可提供能量并減少、損失；施用糞便時保持合理的糞肥和化肥磷比例及施用螢，減少土壤磷養分累積、避免淋洗或徑流過程中磷養分損失。這里就可以用到一款有越來環保設備有限公司生產的一款微濾式固液分離機。